<?php echo "<script>alert('第一行\n第二行');</script>"; ?>

如果其中的javascript代码放在html页面中是可以看见换行效果的，但是如果是在php中动态生成脚本，则\n变成源文件中的换行效果，也就是说这里的\n只是作用于文本文件。
遇到这种问题只需这样：

<?php echo "<script>alert('第一行\\n第二行');</script>"; ?>

多加一个\就行了。两个\\转义为一个\，在javascript里就成了\n。